ایستگاه حرم امام خمینی یکی از ایستگاه‌های ویژه خط ۱ است که در نزدیکی مرقد مطهر امام خمینی (ره) واقع شده است. این ایستگاه به‌ویژه در ایام مذهبی و مناسبت‌های خاص، بسیار شلوغ و پر ازدحام می‌شود. بسیاری از زائران از سراسر کشور از طریق این ایستگاه وارد حرم می‌شوند. دسترسی آسان به بزرگراه‌های اطراف و نزدیکی به شهر آفتاب باعث شده است که این ایستگاه علاوه بر نقش مذهبی، در حمل‌ونقل عمومی نیز اهمیت داشته باشد. امکانات آن شامل پله‌برقی، آسانسور، نمازخانه بزرگ، سرویس بهداشتی، تهویه مطبوع و پایانه تاکسی است.